中糧生物科技始終踐行“綠色發展、環保優先”的管理方針，通過穩定環保裝置運行、提高污染物去除效率、開展全方位管理對標、實施環保技術改造等方式，引導各下屬企業完善環保管理體系，確保環保風險有效受控，從而實現了減少資源消耗、降低環境影響、杜絕環境污染、優化環境質量的管理目標。
       中糧生物科技下屬企業共有17套污水處理裝置，均采用國內先進的污水處理工藝裝備，年處理廢水量2550余萬立方米，2018年COD去除量15萬噸，COD去除效率達到98.5%以上；各下屬企業產生并利用沼氣2465萬標準立方米/年；工業水重復利用率達到95%以上；固體廢物產生量100余萬噸/年，資源化利用率達到98%以上。2018年，中糧生物科技投入了1.1億元開展環保技術改造，實現了豐厚的環境效益和社會效益。
       通過實施專業化、標準化、系統化的環保管理，中糧生物科技建立了全流程的環境風險管控機制，為企業高質量可持續發展提供源源不斷的內生動力。